Bolesti oka

Redovno ažuriranje

Izbor gena se redovno prilagođava aktuelnim naučnim saznanjima.

Fleksibilnost

Uz ExomeXtra® moguće je kombinovati genske setove koji pokrivaju različite bolesti.

Detaljan medicinski nalaz

Uključuje ACMG kriterije korištene za klasifikaciju varijanti.

Najviši kvalitet

Svi koraci analize izvode se u vlastitoj laboratoriji.

Brz rok izrade

Tipično 3–4 sedmice nakon prijema uzorka.

Sigurnost

Najviši standardi povjerljivosti i kvaliteta.

Pouzdanost

Pouzdana podrška kroz sve korake procesa.

Razumljivost

Jasno i pregledno pripremljen medicinski nalaz.

Moguće je naručiti jedan ili više predefiniranih genskih setova. Pored kompletne analize gena naručenog seta, analizu proširujemo dodatnim genima relevantnim za diferencijalnu dijagnozu. Za primarno naručeni set prijavljujemo varijante nepoznatog značaja (ACMG klasa 3), kao i vjerovatno patogene i patogene varijante (klase 4 i 5), dok se za dodatne gene prijavljuju samo varijante klase 4 i 5.

Budući da je panel zasnovan na ExomeXtra® obogaćivanju, bez dodatnog sekvenciranja mogu se naručiti i fenotipski relevantni genski setovi iz drugih panela ili pojedinačni geni; na zahtjev je moguće sastaviti i individualni panel. Uz primarnu dijagnostičku narudžbu opcionalno se mogu naručiti HLA tipizacija, analiza ACMG gena i farmakogenetsko profiliranje.

Retinitis pigmentosa (EYE02, 121 gen)

ABCA4, ABHD12, AGBL5, AHI1, AIPL1, AMACR, ARHGEF18, ARL2BP, ARL3, ARL6, BBS1, BBS2, BEST1, C1QTNF5, CA4, CACNA1F, CC2D2A, CDHR1, CEP290, CERKL, CFAP410, CFAP418, CHM, CLN3, CLRN1, CNGA1, CNGB1, CNGB3, COQ8B, CRB1, CRX, CWC27, CYP4V2, DHDDS, DHX38, EMC1, EYS, FAM161A, FLVCR1, GUCA1B, GUCY2D, HGSNAT, HK1, IDH3A, IDH3B, IFT140, IFT172, IMPDH1, IMPG1, IMPG2, INPP5E, KIAA1549, KIF3B, KIZ, KLHL7, LCA5, LRAT, MAK, MERTK, MFRP, MVK, NEUROD1, NMNAT1, NR2E3, NRL, OFD1, PCARE, PCDH15, PDE6A, PDE6B, PDE6G, POMGNT1, PRCD, PROM1, PRPF3, PRPF31, PRPF4, PRPF6, PRPF8, PRPH2, RAX2, RBP3, RBP4, RCBTB1, RDH11, RDH12, RDH5, REEP6, RGR, RHO, RLBP1, RNU4-2, RNU6-1, RNU6-2, RNU6-8, RNU6-9, RP1, RP1L1, RP2, RPE65, RPGR, RPGRIP1, SAG, SCAPER, SEMA4A, SLC24A1, SLC37A3, SLC4A7, SLC7A14, SNRNP200, SPATA7, TBC1D32, TOPORS, TRNT1, TTC8, TUB, TULP1, USH2A, WDR19, ZNF408, ZNF513

Ahromatopsija (EYE04, 7 gena)

ATF6, CNGA3, CNGB3, CNNM4, GNAT2, PDE6C, PDE6H

Kongenitalno stacionarno noćno sljepilo (EYE06, 18 gena)

CABP4, CACNA1F, CHM, GNAT1, GNB3, GPR179, GRK1, GRM6, GUCY2D, LRIT3, NYX, PDE6B, RBP4, RIMS2, RLBP1, SAG, SLC24A1, TRPM1

Leberova kongenitalna amauroza (EYE08, 24 gena)

AIPL1, ALMS1, CEP290, CRB1, CRX, GUCY2D, IFT140, IMPDH1, INPP5E, IQCB1, KCNJ13, LCA5, LRAT, MERTK, NMNAT1, PROM1, PRPH2, RD3, RDH12, RPE65, RPGRIP1, SPATA7, TULP1, USP45

Stargardtova bolest i makularne distrofije (EYE12, 25 gena)

ABCA4, BEST1, C1QTNF5, CDH3, CDHR1, CFH, CLEC3B, CNGB3, CRB1, CRX, CTNNA1, DRAM2, EFEMP1, ELOVL4, GUCA1A, IMPG1, IMPG2, IRX1, MFSD8, PRDM13, PROM1, PRPH2, RP1L1, SAMD7, TIMP3

Konusne i konus-štapićaste distrofije (EYE13, 48 gena)

ABCA4, ADAM9, AIPL1, ALMS1, BEST1, CABP4, CACNA1F, CACNA2D4, CDHR1, CEP250, CEP290, CEP78, CERKL, CFAP410, CFAP418, CNGA3, CNGB3, CNNM4, CRB1, CRX, DRAM2, GNAT2, GUCA1A, GUCY2D, INPP5E, KCNV2, NMNAT1, PCARE, PDE6C, PDE6H, PITPNM3, POC1B, PROM1, PRPH2, RAB28, RAX2, RDH12, RGS9, RGS9BP, RIMS1, RIMS2, RPGR, RPGRIP1, SEMA4A, TLCD3B, TTLL5, UBAP1L, UNC119

Bolesti pjegaste retine (EYE14, 16 gena)

ABCA4, CHM, CYP4V2, EFEMP1, ELOVL4, KCNJ13, LRAT, OAT, PLA2G5, PRPH2, RDH5, RHO, RLBP1, RPE65, TEAD1, VPS13B

Vitreoretinopatije (familijarna eksudativna vitreoretinopatija / Wagnerov / Norrieov / Knoblochov sindrom) (EYE15, 21 gen)

ATOH7, BEST1, CAPN5, COL18A1, COL2A1, CTNNA1, CTNNB1, FZD4, JAG1, KCNJ13, KIF11, LRP5, NDP, NR2E3, P3H2, RCBTB1, RS1, SNX31, TSPAN12, VCAN, ZNF408

Atrofija optikusa i Leberova hereditarna optička neuropatija (EYE17, 33 gena)

ACO2, AFG3L2, ANTXR1, ATP1A3, CISD2, DNAJC30, DNM1L, FA2H, FDXR, KLC2, MCAT, MECR, MFN2, MIEF1, MT-ND1, MT-ND4, MT-ND6, MTRFR, NDUFA12, NDUFS2, NR2F1, OPA1, OPA3, RTN4IP1, SLC25A46, SLC52A2, SNF8, SPG7, SSBP1, TIMM8A, TMEM126A, UCHL1, WFS1

Malformacije oka (mikroftalmija / anoftalmija / nanoftalmija / kolobom) (EYE20, 43 gena)

ABCB6, ALDH1A3, ATOH7, BCOR, BEST1, BMP4, CHD7, COL4A1, CRB1, FOXE3, FOXL2, FREM1, FREM2, FZD5, GDF3, GDF6, HCCS, HMX1, MAB21L2, MFRP, MYRF, NAA10, NDP, OTX2, PAX2, PAX6, PIGL, PRR12, PRSS56, PXDN, RARB, RAX, RBP4, SHH, SIX6, SMOC1, SOX2, STRA6, TENM3, TMEM98, VAX1, VSX2, YAP1

Katarakta (EYE21, 82 gena)

ABHD12, ADAMTSL4, AGK, ALDH18A1, ARPC4, BCOR, BFSP1, BFSP2, CHMP4B, CLPB, COL18A1, COL4A1, CRYAA, CRYAB, CRYBA1, CRYBA2, CRYBA4, CRYBB1, CRYBB2, CRYBB3, CRYGB, CRYGC, CRYGD, CRYGS, CTDP1, CYP27A1, DNMBP, DPAGT1, EPG5, EPHA2, EYA1, FAR1, FOXE3, FTL, FYCO1, GALK1, GALT, GCNT2, GEMIN4, GFER, GJA1, GJA3, GJA8, HMX1, HSF4, HYCC1, INPP5K, INTS1, JAM3, LEMD2, LIM2, LSS, MAF, MIP, MIR184, MSMO1, NACC1, NDP, NF2, NHS, OCRL, OPA3, P3H2, PAX6, PEX7, PITX3, PXDN, RAB3GAP1, RAB3GAP2, RECQL4, SC5D, SIL1, SIPA1L3, SLC16A12, SLC33A1, TDRD7, UNC45B, VIM, VSX2, WFS1, WRN, ZBTB20

Septo-optička displazija (EYE22, 7 gena)

FGF8, FGFR1, HESX1, OTX2, PAX6, SOX2, SOX3

Glaukom (EYE23, 16 gena)

COL18A1, CYP1B1, EFEMP1, FOXC1, FOXE3, LMX1B, LTBP2, MYOC, NTF4, OPTN, PAX6, PITX2, SLC4A4, TBK1, TEK, WDR36

Distrofije rožnjače (EYE24, 27 gena)

AGBL1, CHST6, COL17A1, COL8A2, CYP4V2, DCN, GLA, GRHL2, GSN, KRT12, KRT3, LCAT, MCOLN1, MIR184, OVOL2, PAX6, PIKFYVE, PRDM5, SLC4A11, TACSTD2, TCF4, TGFBI, TUBA3D, UBIAD1, VSX1, ZEB1, ZNF469

Ectopia lentis (EYE25, 6 gena)

ADAMTSL4, ASPH, CPAMD8, FBN1, LTBP2, P3H2

Infantilni nistagmus (bez albinizma) i hipoplazija foveje (EYE26, 10 gena)

CACNA1A, CACNA1F, CNNM4, DAGLA, FRMD7, GPR143, PAX6, RIMS2, SETX, SLC38A8

Progresivna eksterna oftalmoplegija (EYE27, 17 gena)

DGUOK, DNA2, MGME1, MYF5, MYH2, OPA1, POLG, POLG2, RNASEH1, ROBO3, RRM2B, SLC25A4, SPG7, TK2, TOP3A, TWNK, TYMP

Kongenitalni poremećaji kranijalne inervacije / strabizam (EYE28, 14 gena)

CHN1, ECEL1, HOXA1, HOXB1, KIF21A, MAFB, MYH10, PHOX2A, PLXND1, ROBO3, SALL4, TUBA1A, TUBB2B, TUBB3

Sljedeći setovi vezani za oko naručuju se u okviru drugih dijagnostičkih panela, ali se mogu kombinovati s panelom za bolesti oka.

Usherov sindrom (EYE01)

Kombinacija senzorineuralnog gubitka sluha i degeneracije retine; najčešći uzrok gluhosljepoće, nasljeđuje se autosomno recesivno. Naručuje se u okviru panela za gubitak sluha (set EAR05).

Bardet-Biedlov sindrom (EYE05)

Cilopatija i drugi najčešći uzrok sindromske degeneracije retine — konus-štapićasta distrofija, gojaznost, polidaktilija, intelektualne teškoće i bolest bubrega. Naručuje se u okviru panela za cilopatije (set CIL03).

Joubertov sindrom (EYE07)

Cilopatija s karakterističnim znakom „molarnog zuba“ na MRI mozga, hipotonijom, ataksijom i mogućom distrofijom retine. Naručuje se u okviru panela za cilopatije.

Senior-Løkenov sindrom (EYE11)

Autosomno recesivna okulo-renalna cilopatija koju karakteriše kombinacija nefronoftize i distrofije retine. Naručuje se u okviru panela za cilopatije (set CIL04).

Sticklerov sindrom (EYE16)

Artro-oftalmopatija s juvenilnom kataraktom, izraženom miopijom, vitreoretinalnom degeneracijom i ablacijom retine, uz rascjep nepca, gubitak sluha i promjene zglobova. Naručuje se u okviru panela za bolesti vezivnog tkiva (set CTD01).

Okularni i okulokutani albinizam (EYE18)

Potpuni ili djelimični gubitak melanina u oku (OA), odnosno i u koži i dlaci (OCA), s nistagmusom, hipoplazijom foveje i smanjenom oštrinom vida. Naručuje se u okviru panela za bolesti kože (set DRM01).

Sindromski albinizam (Hermansky-Pudlak / Waardenburg / Vici / Griscelli / Chediak-Higashi) (EYE19)

Nasljedni sindromi s okulokutanim albinizmom uz sklonost infekcijama, sklonost krvarenju i neurološke simptome. Naručuje se u okviru panela za bolesti kože (set DRM02).

ABCA4, ABCB6, ABHD12, ACO2, ADAM9, ADAMTSL4, AFG3L2, AGBL1, AGBL5, AGK, AHI1, AIPL1, ALDH18A1, ALDH1A3, ALMS1, AMACR, ANTXR1, ARHGEF18, ARL2BP, ARL3, ARL6, ARPC4, ASPH, ATF6, ATOH7, ATP1A3, BBS1, BBS2, BCOR, BEST1, BFSP1, BFSP2, BMP4, C1QTNF5, CA4, CABP4, CACNA1A, CACNA1F, CACNA2D4, CAPN5, CC2D2A, CDH3, CDHR1, CEP250, CEP290, CEP78, CERKL, CFAP410, CFAP418, CFH, CHD7, CHM, CHMP4B, CHN1, CHST6, CISD2, CLEC3B, CLN3, CLPB, CLRN1, CNGA1, CNGA3, CNGB1, CNGB3, CNNM4, COL17A1, COL18A1, COL2A1, COL4A1, COL8A2, COQ8B, CPAMD8, CRB1, CRX, CRYAA, CRYAB, CRYBA1, CRYBA2, CRYBA4, CRYBB1, CRYBB2, CRYBB3, CRYGB, CRYGC, CRYGD, CRYGS, CTDP1, CTNNA1, CTNNB1, CWC27, CYP1B1, CYP27A1, CYP4V2, DAGLA, DCN, DGUOK, DHDDS, DHX38, DNA2, DNAJC30, DNM1L, DNMBP, DPAGT1, DRAM2, ECEL1, EFEMP1, ELOVL4, EMC1, EPG5, EPHA2, EYA1, EYS, FA2H, FAM161A, FAR1, FBN1, FDXR, FGF8, FGFR1, FLVCR1, FOXC1, FOXE3, FOXL2, FREM1, FREM2, FRMD7, FTL, FYCO1, FZD4, FZD5, GALK1, GALT, GCNT2, GDF3, GDF6, GEMIN4, GFER, GJA1, GJA3, GJA8, GLA, GNAT1, GNAT2, GNB3, GPR143, GPR179, GRHL2, GRK1, GRM6, GSN, GUCA1A, GUCA1B, GUCY2D, HCCS, HESX1, HGSNAT, HK1, HMX1, HOXA1, HOXB1, HSF4, HYCC1, IDH3A, IDH3B, IFT140, IFT172, IMPDH1, IMPG1, IMPG2, INPP5E, INPP5K, INTS1, IQCB1, IRX1, JAG1, JAM3, KCNJ13, KCNV2, KIAA1549, KIF11, KIF21A, KIF3B, KIZ, KLC2, KLHL7, KRT12, KRT3, LCA5, LCAT, LEMD2, LIM2, LMX1B, LRAT, LRIT3, LRP5, LSS, LTBP2, MAB21L2, MAF, MAFB, MAK, MCAT, MCOLN1, MECR, MERTK, MFN2, MFRP, MFSD8, MGME1, MIEF1, MIP, MIR184, MSMO1, MT-ND1, MT-ND4, MT-ND6, MTRFR, MVK, MYF5, MYH10, MYH2, MYOC, MYRF, NAA10, NACC1, NDP, NDUFA12, NDUFS2, NEUROD1, NF2, NHS, NMNAT1, NR2E3, NR2F1, NRL, NTF4, NYX, OAT, OCRL, OFD1, OPA1, OPA3, OPTN, OTX2, OVOL2, P3H2, PAX2, PAX6, PCARE, PCDH15, PDE6A, PDE6B, PDE6C, PDE6G, PDE6H, PEX7, PHOX2A, PIGL, PIKFYVE, PITPNM3, PITX2, PITX3, PLA2G5, PLXND1, POC1B, POLG, POLG2, POMGNT1, PRCD, PRDM13, PRDM5, PROM1, PRPF3, PRPF31, PRPF4, PRPF6, PRPF8, PRPH2, PRR12, PRSS56, PXDN, RAB28, RAB3GAP1, RAB3GAP2, RARB, RAX, RAX2, RBP3, RBP4, RCBTB1, RD3, RDH11, RDH12, RDH5, RECQL4, REEP6, RGR, RGS9, RGS9BP, RHO, RIMS1, RIMS2, RLBP1, RNASEH1, RNU4-2, RNU6-1, RNU6-2, RNU6-8, RNU6-9, ROBO3, RP1, RP1L1, RP2, RPE65, RPGR, RPGRIP1, RRM2B, RS1, RTN4IP1, SAG, SALL4, SAMD7, SC5D, SCAPER, SEMA4A, SETX, SHH, SIL1, SIPA1L3, SIX6, SLC16A12, SLC24A1, SLC25A4, SLC25A46, SLC33A1, SLC37A3, SLC38A8, SLC4A11, SLC4A4, SLC4A7, SLC52A2, SLC7A14, SMOC1, SNF8, SNRNP200, SNX31, SOX2, SOX3, SPATA7, SPG7, SSBP1, STRA6, TACSTD2, TBC1D32, TBK1, TCF4, TDRD7, TEAD1, TEK, TENM3, TGFBI, TIMM8A, TIMP3, TK2, TLCD3B, TMEM126A, TMEM98, TOP3A, TOPORS, TRNT1, TRPM1, TSPAN12, TTC8, TTLL5, TUB, TUBA1A, TUBA3D, TUBB2B, TUBB3, TULP1, TWNK, TYMP, UBAP1L, UBIAD1, UCHL1, UNC119, UNC45B, USH2A, USP45, VAX1, VCAN, VIM, VPS13B, VSX1, VSX2, WDR19, WDR36, WFS1, WRN, YAP1, ZBTB20, ZEB1, ZNF408, ZNF469, ZNF513

Obogaćivanje kodirajućih i susjednih intronskih regija vrši se tehnologijom hibridizacije u otopini. Selekcija ciljanih regija i dizajn sondi izvode se interno. Sekvenciranje se provodi na Illumina platformama, a bioinformatička obrada, detekcija CNV-a i medicinska interpretacija u potpunosti se rade u vlastitoj laboratoriji.

1.

Savjetovanje i odabir testa

Zajedno s vama i vašim oftalmologom određujemo koji je genski set ili kombinacija setova najprikladnija za kliničku sliku.

2.

Uzorkovanje i slanje

Uzorak se uzima u našoj ustanovi ili kod uputnog ljekara i sigurno transportuje do laboratorije.

3.

Analiza uzorka

ExomeXtra® obogaćivanje, sekvenciranje visokog protoka i bioinformatička obrada uz detekciju CNV-a.

4.

Nalaz i savjetovanje

Detaljan medicinski nalaz s ACMG klasifikacijom varijanti i preporukama, uz mogućnost konsultacije.

• 1–2 ml EDTA krvi (preporučeni tip uzorka)
• Genomska DNK (1–2 µg)
• DBS kartice, bris obraza ili pljuvačka također su mogući

• HLA tipizacija — HLA klasa I (geni A, B, C) i HLA klasa II (geni DPA1, DPB1, DQA1, DQB1, DRB1, DRB3, DRB4, DRB5)
• Analiza ACMG gena — izvještavanje o patogenim varijantama (klase 4 i 5) u odabranim genima za koje postoji preporučeni postupak liječenja ili praćenja (sekundarni nalazi)
• Farmakogenetska analiza (PGx) — analiza varijanti u genima uključenim u metabolizam lijekova, radi prilagođavanja terapije i smanjenja nuspojava

Kome je namijenjen panel za bolesti oka?

Panel je namijenjen pacijentima s nasljednim bolestima retine (retinitis pigmentosa, makularne distrofije, konus-štapićaste distrofije), kongenitalnom kataraktom, glaukomom, distrofijama rožnjače, atrofijom optikusa, nistagmusom, malformacijama oka te sindromskim oblicima s očnim simptomima.

Koliko traje izrada nalaza?

Nalaz je tipično gotov 3–4 sedmice nakon prijema uzorka u laboratoriji.

Koji uzorak je potreban?

Preporučuje se 1–2 ml EDTA krvi. Alternativno su prihvatljivi genomska DNK (1–2 µg), DBS kartice, bris obraza ili pljuvačka.

Zašto je genetska dijagnoza bolesti oka važna?

Genetska dijagnoza razjašnjava uzrok bolesti, omogućava procjenu prognoze i toka bolesti, genetsko savjetovanje porodice, a u pojedinim slučajevima i pristup ciljanim terapijama ili kliničkim studijama (npr. genska terapija kod RPE65-povezane distrofije retine).