Glosar
Pojmovi genetskog testiranja i onkologije.
85 pojmova objašnjenih jednostavnim jezikom, ali klinički točno — od biomarkera i metoda testiranja do nasljednih sindroma i farmakogenomike.
Kategorije: Biomarkeri i geni · Testovi i metode · Klinički pojmovi · Nasljedni sindromi · Vrste karcinoma · Farmakogenomika
Biomarkeri i geni
- ALK
- Gen čije fuzije pokreću rast tumora, najčešće kod karcinoma pluća nemalih ćelija. ALK-pozitivni tumori liječe se specifičnim ALK inhibitorima.
- ATM
- Gen koji pokreće odgovor ćelije na oštećenje DNK. Mutacije povećavaju rizik od karcinoma dojke, prostate i pankreasa i mogu utjecati na izbor terapije.
- BAP1
- Tumorski supresorski gen čije nasljedne mutacije povećavaju rizik od uvealnog melanoma, mezotelioma i karcinoma bubrega.
- Biomarker
- Mjerljiva biološka osobina — najčešće promjena u genu, proteinu ili DNK tumora — koja govori nešto o bolesti. U onkologiji biomarker pomaže da se predvidi kako će bolest teći i da li će određena terapija djelovati.
Poznato i kao: biološki marker
- BRAF
- Gen koji prenosi signale za rast ćelije. Mutacija BRAF V600E česta je kod melanoma, a javlja se i kod karcinoma štitne žlijezde te kolorektalnog karcinoma; liječi se kombinacijom BRAF i MEK inhibitora.
- BRCA1 i BRCA2
- Geni za popravku dvolančanih lomova DNK. Nasljedne mutacije značajno povećavaju rizik od karcinoma dojke, jajnika, prostate i pankreasa, a tumori s ovim mutacijama često odgovaraju na PARP inhibitore.
Poznato i kao: BRCA gen, BRCA mutacija
- CDKN2A
- Tumorski supresorski gen; nasljedne mutacije su najčešći poznati uzrok porodičnog melanoma i povezane su i s karcinomom pankreasa.
- Deficit homologne rekombinacije(HRD)
- Stanje u kojem tumor ne može ispravno popraviti dvolančane lomove DNK. HRD-pozitivni tumori, tipično kod karcinoma jajnika, osjetljiviji su na PARP inhibitore i platinske lijekove.
- EGFR
- Receptor za epidermalni faktor rasta. Mutacije EGFR gena česte su kod karcinoma pluća nemalih ćelija i liječe se EGFR inhibitorima u obliku tableta.
- Fuzija gena
- Spajanje dijelova dva različita gena u jedan, čime nastaje protein koji trajno potiče rast tumora. Fuzije ALK, ROS1, RET i NTRK gena često imaju vrlo djelotvornu ciljanu terapiju.
Poznato i kao: genska fuzija, translokacija
- Gen
- Dio DNK koji nosi uputu za izradu jednog proteina. Promjena u genu može poremetiti rad proteina i pokrenuti nekontroliranu diobu ćelija.
- Germinativna mutacija
- Mutacija prisutna u svim ćelijama tijela od rođenja. Povećava rizik od određenih karcinoma i može se prenijeti na djecu, pa je nalaz važan i za porodicu.
Poznato i kao: nasljedna mutacija, zametna mutacija
- HER2
- Receptor koji je kod dijela karcinoma dojke i želuca prekomjerno izražen ili umnožen. HER2-pozitivni tumori liječe se anti-HER2 lijekovima, a nalaz se potvrđuje imunohistokemijom i FISH-om.
Poznato i kao: ERBB2
- KRAS
- Jedan od najčešće mutiranih onkogena, posebno kod karcinoma pankreasa, debelog crijeva i pluća. Za pojedine varijante (npr. KRAS G12C) danas postoje ciljani lijekovi.
- MET
- Gen čije umnožavanje ili preskakanje egzona 14 pokreće rast tumora, najčešće kod karcinoma pluća. Postoje odobreni MET inhibitori.
- Mikrosatelitna nestabilnost(MSI)
- Stanje u kojem tumor gubi sposobnost popravke grešaka u DNK, pa se kratki ponavljajući dijelovi genoma (mikrosateliti) skraćuju ili produžuju. MSI-high tumori često dobro odgovaraju na imunoterapiju.
- Mutacija
- Promjena u slijedu DNK. Somatske mutacije nastaju tokom života samo u ćelijama tumora, a germinativne (nasljedne) mutacije prisutne su u svim ćelijama tijela i mogu se prenijeti na potomstvo.
Poznato i kao: genetska promjena, varijanta
- NTRK fuzije
- Rijetke fuzije NTRK1, NTRK2 i NTRK3 gena koje se javljaju u mnogim vrstama tumora. Neovisno o organu porijekla, liječe se TRK inhibitorima s vrlo visokim stopama odgovora.
- Onkogen
- Gen koji, kada se aktivira mutacijom ili umnožavanjem, potiče nekontrolirani rast ćelija. Mnogi onkogeni (EGFR, ALK, BRAF, KRAS) direktno su meta ciljanih lijekova.
- PD-L1
- Protein na površini tumorskih ćelija koji koči napad imunoloških ćelija. Njegova izraženost mjeri se imunohistokemijom i u više dijagnoza određuje da li je imunoterapija indicirana.
- Popravka pogrešno sparenih baza(MMR)
- Sistem koji ispravlja greške nastale pri kopiranju DNK. Kada ne radi (dMMR), tumor nakuplja mutacije i pokazuje mikrosatelitnu nestabilnost.
Poznato i kao: mismatch repair, dMMR
- Prediktivni biomarker
- Biomarker koji predviđa odgovor na konkretan lijek. Za razliku od prognostičkog biomarkera, koji govori o vjerovatnom toku bolesti, prediktivni biomarker direktno usmjerava izbor terapije.
- Prognostički biomarker
- Biomarker koji govori o vjerovatnom toku bolesti neovisno o terapiji — na primjer o riziku povrata bolesti. Koristi se za procjenu koliko intenzivno liječenje je potrebno.
- RET
- Gen čije fuzije i točkaste mutacije pokreću tumore štitne žlijezde i pluća. Selektivni RET inhibitori dio su standardnog liječenja kod pozitivnog nalaza.
- ROS1
- Gen čije fuzije nalazimo u malom udjelu karcinoma pluća i nekih drugih tumora. Postoje odobreni lijekovi koji ciljano blokiraju ROS1.
- Somatska mutacija
- Mutacija koja nastaje u ćelijama tumora tokom života i ne nasljeđuje se. Većina promjena koje se traže profiliranjem tumora spada u ovu grupu.
- Tumorski markeri
- Tvari (najčešće proteini) mjerljive u krvi koje mogu biti povišene kod tumora, npr. CA 15-3, CEA ili PSA. Nisu dovoljni za dijagnozu, ali pomažu u praćenju toka bolesti.
Poznato i kao: tumor markeri
- Tumorski supresorski gen
- Gen koji koči diobu ćelija i popravlja oštećenja DNK. Gubitak njegove funkcije (npr. TP53, BRCA1/2, ATM) uklanja prirodnu kočnicu i doprinosi nastanku tumora.
- Tumorsko mutacijsko opterećenje(TMB)
- Broj mutacija po megabazi DNK tumora. Visok TMB znači da tumor nosi mnogo promjena koje imunološki sistem može prepoznati, pa se često koristi kao pokazatelj vjerovatnoće odgovora na imunoterapiju.
Poznato i kao: mutacijsko opterećenje tumora
Testovi i metode
- Biopsija
- Uzimanje uzorka tkiva radi mikroskopske i molekularne analize. Osnovni je postupak za potvrdu dijagnoze karcinoma i izvor materijala za genomske testove.
- BluePrint
- Test koji određuje molekularni podtip karcinoma dojke (luminalni, HER2, bazalni) i uz MammaPrint precizira biologiju tumora te očekivani odgovor na terapiju.
- Cirkulirajuća tumorska DNK(ctDNA)
- Fragmenti DNK koje tumor otpušta u krvotok. Mjerenje ctDNA omogućava neinvazivnu analizu mutacija i vrlo rano otkrivanje povrata bolesti.
- Egzomsko sekvenciranje(WES)
- Čitanje svih dijelova genoma koji kodiraju proteine (oko 20.000 gena). Prvi je izbor kod nejasnih kliničkih slika i sumnje na rijetku nasljednu bolest.
Poznato i kao: egzomska dijagnostika
- FFPE uzorak
- Tkivo fiksirano formalinom i uklopljeno u parafin — standardni oblik u kojem se čuvaju uzorci biopsije. Većina genomskih testova radi upravo iz FFPE bloka ili rezova.
- FISH
- Metoda fluorescentne in situ hibridizacije kojom se u tkivu vide umnožavanja gena i fuzije, npr. HER2 amplifikacija ili ALK preslagivanja.
- FoundationOne CDx
- Sveobuhvatni genomski test partnerske laboratorije Foundation Medicine koji iz tkiva tumora analizira više stotina gena i daje izvještaj s terapijskim opcijama i kliničkim ispitivanjima.
Poznato i kao: FoundationOne
- Genetsko savjetovanje
- Razgovor sa stručnjakom prije i poslije genetskog testiranja o tome šta test može pokazati, šta nalaz znači za pacijenta i porodicu te koje su daljnje opcije.
- Genetsko testiranje
- Laboratorijska analiza DNK kojom se traže promjene u genima — u tumoru, krvi ili drugom uzorku. Rezultat pomaže u izboru terapije, potvrdi dijagnoze ili procjeni nasljednog rizika.
Poznato i kao: genetičko testiranje
- Genomsko testiranje
- Analiza velikog dijela genoma odjednom — najčešće stotina gena u tumoru (sveobuhvatno genomsko profiliranje) ili cjelokupnog egzoma kod rijetkih bolesti. Cilj je otkriti sve promjene koje mogu uticati na dijagnozu ili terapiju, bez unaprijed odabranog gena.
Poznato i kao: genomska analiza
- Genski panel
- Test koji analizira unaprijed odabranu grupu gena povezanih s jednom bolešću ili grupom bolesti. Brži je i jednostavniji za tumačenje od egzoma.
Poznato i kao: panel gena
- Imunohistokemija(IHC)
- Metoda kojom se antitijelima boje proteini u tkivu, npr. HER2, hormonski receptori ili PD-L1. Brza je i dostupna, a često prethodi složenijim molekularnim testovima.
- MammaPrint
- Test genske ekspresije partnera Agendia koji kod ranog karcinoma dojke procjenjuje rizik od povrata bolesti i pomaže u odluci o potrebi kemoterapije.
- Molekularna rezidualna bolest(MRD)
- Vrlo mala količina tumorske DNK koja ostaje u tijelu nakon operacije ili terapije, ispod granice vidljivosti radioloških metoda. Pozitivan MRD nalaz ukazuje na povišen rizik od povrata bolesti.
- Molekularni tumorski board
- Multidisciplinarni sastanak na kojem onkolozi, patolozi i molekularni biolozi zajedno tumače genomski nalaz i predlažu terapijski plan za konkretnog pacijenta.
- Patološki nalaz
- Izvještaj patologa o vrsti tumora, gradusu, proširenosti i imunohistokemijskim markerima. Polazna je tačka za planiranje liječenja i za odabir genomskog testa.
- Rano otkrivanje
- Pronalaženje tumora u ranoj fazi, prije širenja. Uz klasične metode danas se koriste i krvni testovi koji traže signale tumorske DNK.
- Sekvenciranje cijelog genoma(WGS)
- Čitanje kompletne DNK, uključujući dijelove izvan gena. Otkriva promjene koje egzom i paneli ne vide, ali zahtijeva složeniju interpretaciju.
- Sekvenciranje nove generacije(NGS)
- Tehnologija koja istovremeno čita stotine ili hiljade gena iz jednog uzorka. Osnova je savremenih genomskih testova jer u jednom postupku otkriva mutacije, fuzije i umnožavanja.
- Signatera
- Personalizirani test partnera Natera za praćenje molekularne rezidualne bolesti. Prilagođava se mutacijama konkretnog tumora i prati ctDNA u krvi tokom vremena.
- Skrining
- Testiranje osoba bez simptoma radi ranog otkrivanja bolesti, npr. mamografija ili kolonoskopija. Cilj je otkriti promjene dok su još lako izlječive.
- Sveobuhvatno genomsko profiliranje(CGP)
- Analiza velikog broja gena u tumoru odjednom, uključujući TMB i MSI. Cilj je pronaći sve promjene za koje postoji odobrena ciljana terapija ili kliničko ispitivanje.
Poznato i kao: profiliranje tumora, genomsko profiliranje
- Tečna biopsija
- Analiza tumorske DNK iz uzorka krvi umjesto iz tkiva. Koristi se kada tkivo nije dostupno ili nije dovoljno, te za praćenje promjena tokom liječenja.
Poznato i kao: likvidna biopsija
- Varijanta nepoznatog značaja(VUS)
- Genetska promjena za koju trenutno nema dovoljno dokaza da bi se označila kao bezopasna ili patogena. Ne koristi se za kliničke odluke, ali se može reklasificirati s novim saznanjima.
Klinički pojmovi
- Ciljana terapija
- Lijekovi koji blokiraju konkretnu molekularnu promjenu u tumoru, npr. EGFR ili ALK. Djeluju preciznije od kemoterapije i obično imaju drugačiji profil nuspojava.
- Epigenetika
- Proučavanje promjena u aktivnosti gena koje ne mijenjaju sam slijed DNK, npr. metilacije. Neki epigenetski markeri koriste se u dijagnostici i prognozi tumora.
- Gradus
- Mjera koliko tumorske ćelije pod mikroskopom odstupaju od normalnih. Viši gradus obično znači agresivniji tumor i brži rast.
- Imunoterapija
- Liječenje koje aktivira vlastiti imunološki sistem da prepozna i uništi tumorske ćelije. Najčešće se koriste inhibitori kontrolnih tačaka, a nalaz PD-L1, MSI i TMB pomaže u odabiru pacijenata.
- Kemoterapija
- Liječenje lijekovima koji uništavaju ćelije koje se brzo dijele. Djeluje na cijeli organizam, pa uzrokuje poznate nuspojave, ali je i dalje temelj liječenja mnogih karcinoma.
Poznato i kao: hemoterapija
- Klinička ispitivanja
- Istraživanja u kojima se ispituju novi lijekovi i pristupi liječenju. Genomski nalaz često otvara pristup ispitivanju koje inače ne bi bilo opcija.
- Metastaza
- Širenje tumora iz mjesta nastanka u druge organe. Metastatska bolest zahtijeva sistemsko liječenje, u kojem genomski nalaz najčešće i ima najveću ulogu.
Poznato i kao: metastatska bolest
- Nuspojave
- Neželjeni učinci liječenja, od umora i mučnine do promjena krvne slike. Mogu se ublažiti potpornom terapijom, a dio ih se predvidjeti farmakogenomskim testiranjem.
Poznato i kao: neželjeni efekti
- PARP inhibitor
- Lijek koji blokira alternativni put popravke DNK. Kod tumora s BRCA mutacijom ili HRD-om ćelija ostaje bez ijednog ispravnog mehanizma popravke i propada.
- Precizna medicina
- Pristup u kojem se terapija bira prema biološkim osobinama bolesti i pacijenta, a ne samo prema lokaciji tumora. U onkologiji se oslanja na genomsku analizu tumora.
Poznato i kao: personalizirana medicina
- Prekancerozne promjene
- Promjene tkiva koje još nisu karcinom, ali nose povišen rizik da to postanu. Pravovremeno uklanjanje sprječava razvoj bolesti.
- Recidiv
- Ponovna pojava bolesti nakon perioda bez znakova tumora. Praćenje ctDNA može otkriti recidiv mjesecima prije nego što postane vidljiv na snimkama.
Poznato i kao: povrat bolesti, relaps
- Remisija
- Smanjenje ili nestanak znakova bolesti nakon liječenja. Potpuna remisija znači da se bolest više ne može detektirati dostupnim metodama, ali ne isključuje kasniji recidiv.
- Stadij bolesti
- Mjera proširenosti tumora, najčešće po TNM sistemu (veličina tumora, zahvaćenost limfnih čvorova, udaljene metastaze). Određuje plan liječenja i prognozu.
Poznato i kao: stadijum
- Tumor-agnostička terapija
- Terapija odobrena prema molekularnoj promjeni, a ne prema organu iz kojeg tumor potječe — npr. TRK inhibitori kod NTRK fuzija ili imunoterapija kod MSI-high tumora.
Nasljedni sindromi
- Li-Fraumeni sindrom
- Rijedak nasljedni sindrom uzrokovan mutacijom TP53 gena, s visokim rizikom od više različitih tumora već u mlađoj dobi.
- Lynch sindrom
- Nasljedni sindrom uzrokovan mutacijom MMR gena koji značajno povećava rizik od kolorektalnog karcinoma, karcinoma endometrija i drugih tumora. Zahtijeva ranije i češće kolonoskopije.
- Nasljedni rizik
- Povišena vjerovatnoća razvoja karcinoma zbog germinativne mutacije naslijeđene u porodici. Nalaz omogućava pojačano praćenje i preventivne mjere za srodnike.
- Neurofibromatoza tip 1(NF1)
- Nasljedna bolest uzrokovana mutacijom NF1 gena, s promjenama na koži i nervnom sistemu te povišenim rizikom od pojedinih tumora.
- Rijetke bolesti
- Bolesti koje pogađaju mali broj ljudi, a velikim dijelom imaju genetski uzrok. Egzomsko sekvenciranje i ciljani paneli često su jedini put do dijagnoze.
Vrste karcinoma
- Karcinom
- Zloćudni tumor nastao nekontroliranom diobom ćelija koje mogu prodrijeti u okolno tkivo i stvoriti metastaze. Naziv se najčešće odnosi na tumore epitelnog porijekla.
Poznato i kao: rak, maligni tumor
- Karcinom dojke
- Najčešći karcinom kod žena. Podtip se određuje hormonskim receptorima i HER2 statusom, a testovi genske ekspresije pomažu u odluci o kemoterapiji.
Poznato i kao: rak dojke
- Karcinom pluća
- Tumor kod kojeg genomsko profiliranje ima najveću ulogu — EGFR, ALK, ROS1, RET, MET i drugi biomarkeri direktno određuju ciljanu terapiju.
Poznato i kao: rak pluća
- Kolorektalni karcinom
- Karcinom debelog crijeva i rektuma. Obavezno se određuju RAS i BRAF status te MSI, a kod mlađih pacijenata razmatra se i Lynch sindrom.
- Melanom
- Zloćudni tumor pigmentnih ćelija kože. Rano otkrivanje po ABCDE pravilu bitno mijenja ishod, a kod uznapredovale bolesti BRAF status određuje terapiju.
- Sarkom
- Rijetka grupa tumora mekih tkiva i kostiju. Molekularna dijagnostika često je nužna za tačnu klasifikaciju podtipa.
- Tumor nepoznatog primarnog porijekla(CUP)
- Metastatska bolest kod koje se ne može utvrditi organ iz kojeg tumor potječe. Genomsko profiliranje može ukazati na porijeklo i otvoriti terapijske opcije.
Farmakogenomika
- CYP2D6
- Enzim koji razgrađuje veliki broj lijekova, uključujući tamoksifen i pojedine antidepresive. Brzi i spori metabolizatori mogu trebati drugačiju dozu ili drugi lijek.
- DPYD
- Gen koji određuje razgradnju fluoropirimidina (5-FU, kapecitabin). Nositelji određenih varijanti izloženi su riziku od teške toksičnosti pa im je potrebna smanjena doza.
- Farmakogenomika(PGx)
- Analiza gena koji određuju kako organizam razgrađuje lijekove. Pomaže u odabiru doze i izbjegavanju ozbiljnih nuspojava prije početka terapije.
- TPMT
- Gen koji utječe na metabolizam tiopurina. Smanjena aktivnost enzima povećava rizik od jake mijelosupresije, pa se doza prilagođava prema nalazu.
- UGT1A1
- Gen koji utječe na razgradnju irinotekana. Određene varijante povećavaju rizik od neutropenije i proljeva, što se rješava prilagodbom doze.
Nešto u nalazu vam nije jasno?
Pošaljite nam dokumentaciju — objašnjavamo nalaz i pomažemo u odabiru testa koji zaista može promijeniti odluku o liječenju.
Zatražite konsultaciju