Profiliranje potvrđenog tumora za izbor terapije

Ova usluga je kreirana za pacijente kod kojih je malignitet već potvrđen i koji, zajedno sa svojim onkologom, traže najinformativniji sljedeći korak. Najviše smisla ima u sljedećim situacijama:

• Postoji više mogućih terapijskih opcija i potrebno ih je suziti na najracionalniji izbor.
• Traži se specifičan biomarker za uvođenje ciljane terapije ili imunoterapije.
• Bolest nije adekvatno odgovorila na standardni onkološki pristup.
• Radi se o uznapredovalom, rijetkom ili biološki kompleksnom tumoru.
• Razmatra se mogućnost uključivanja pacijenta u kliničku studiju.

To nije "samo još jedan nalaz", nego dubinsko čitanje biologije tumora.

Biomarker testiranje traži specifične genetske, proteinske i druge promjene u tumorskim ćelijama. Zavisno od kliničke potrebe, testovi mogu analizirati pojedinačne biomarkere, dok napredniji paneli i sveobuhvatno genomsko profiliranje (CGP) analiziraju stotine gena istovremeno. Također procjenjujemo i mutacijsko opterećenje tumora (TMB), dok liquid biopsy testovi omogućavaju analizu tumorskih biomarkera direktno iz krvi.

Cilj nije samo "naći mutaciju", već razumjeti:

Postoji li jasna meta za ciljanu terapiju.

Postoji li signal da će imunoterapija biti efikasna.

Postoje li markeri rezistencije koji govore da određeni lijek treba izbjeći.

Ima li osnove za alternativne pristupe.

Najveća vrijednost profiliranja je u tome što liječenje prestaje biti generičko. Umjesto općeg pitanja: "Koja je standardna terapija za ovu dijagnozu?", prelazimo na usmjereno pitanje: "Koja terapija ima najviše smisla za ovaj konkretan tumor, sa ovim specifičnim biomarkerima?"

Rezultat testiranja može otvoriti vrata registriranim lijekovima, off-label opcijama ili kliničkim ispitivanjima. To je upravo ono što pacijentu i onkologu treba u realnom životu: ne više informacija radi gomilanja podataka, nego jasna informacija koja vodi ka konkretnoj odluci.

Somatsko profiliranje analizira promjene nastale u samom tumoru tokom njegovog razvoja. One nisu prisutne u ostalim ćelijama tijela i ne prenose se na potomstvo. Nasljedne (germinativne) promjene prisutne su u svim ćelijama od rođenja i analiziraju se iz krvi — njihov nalaz je važan i za srodnike.

Ukoliko u porodici postoji više slučajeva karcinoma ili se bolest javila u mlađoj dobi, uz profiliranje tumora razmatra se i genetsko testiranje na nasljedni rizik.

• Nasljedni rizik od karcinoma

Svaka od navedenih platformi ima svoje mjesto u kliničkoj praksi. Izbor zavisi od vrste i količine dostupnog uzorka, tipa tumora, faze bolesti i konkretnog kliničkog pitanja — a donosi se zajedno s vašim onkologom.

FoundationOne® CDx (Foundation Medicine)

Sveobuhvatno genomsko profiliranje (CGP) solidnih tumora iz FFPE tumorskog tkiva (parafinski blok ili neobojena stakalca s dovoljnim udjelom tumorskih ćelija). Analizira 324 gena i otkriva sve četiri klase genomskih promjena: supstitucije baza, insercije/delecije, promjene broja kopija i preuređenja gena (fuzije). Uz to izvještava o genomskim potpisima — mikrosatelitnoj nestabilnosti (MSI) i tumorskom mutacijskom opterećenju (TMB). Test je odobren od FDA kao prateća dijagnostika (companion diagnostic) za veći broj ciljanih terapija.

• Foundation Medicine — opis i dokumenti za preuzimanje
• Foundation Medicine IHC portfolio (dopuna FoundationOne testiranju)
• FoundationOne testovi
• Tumorsko mutacijsko opterećenje (TMB)
• Mikrosatelitna nestabilnost (MSI)

FoundationOne® Liquid CDx (Foundation Medicine)

Sveobuhvatno genomsko profiliranje iz uzorka periferne krvi — tečna biopsija koja analizira cirkulirajuću tumorsku DNK (ctDNA) u 324 gena, uključujući MSI, procjenu TMB iz krvi i amplifikacije. Razmatra se kada tumorsko tkivo nije dostupno, nije dovoljno za analizu ili bi nova biopsija bila rizična, te kod uznapredovale ili metastatske bolesti kada je potreban uvid u aktuelni genomski profil tumora.

• Foundation Medicine
• Tečna biopsija (ctDNA) — kada je alternativa

Natera Altera™

Genomsko profiliranje koje kombinira sekvenciranje cijelog egzoma (WES) i cijelog transkriptoma (WTS). Analizira se FFPE tumorsko tkivo uz uzorak krvi kao normalnu kontrolu, čime se somatske promjene pouzdano odvajaju od nasljednih. Altera detektira SNV, insercije/delecije, promjene broja kopija (CNA), MSI i TMB, dok RNA analiza otkriva fuzije gena važne za izbor ciljane terapije. Rezultat sekvenciranja može poslužiti i kao osnova za personalizirani Signatera™ test praćenja minimalne rezidualne bolesti.

• Natera
• Praćenje bolesti i ranog recidiva (Signatera™)

CeGaT — CancerPrecision®, CancerEssential®, CancerFusionRx®

Akreditirani somatski paneli njemačke laboratorije CeGaT (Tübingen). CancerEssential obuhvata tumor-specifične panele za najčešće karcinome (pluća, kolorektalni, dojka, prostata, želudac i drugi), CancerPrecision predstavlja širi panel za sveobuhvatnu analizu, a CancerFusionRx ciljanu RNA analizu fuzijskih transkripata. Uz nalaz je dostupna i strukturirana terapijska preporuka (CancerAdvice).

• CeGaT
• Organ-specifični tumorski paneli

DATAR exacta® i CellDx™

Exacta je multi-omička analiza solidnih tumora koja obuhvata više od 20.000 gena (DNK i RNK), uz mogućnost kombiniranja analize tkiva i krvi, a namijenjena je posebno uznapredovalim i na terapiju refraktornim tumorima. CellDx-Tissue je profilacija tumorskog tkiva s fokusom na personalizaciju terapije i biomarkere imunoterapije (PD-L1, TMB, MMR/MSI); ima FDA 510(k) clearance (K260235).

• DATAR Cancer Genetics
• Funkcionalno testiranje osjetljivosti na terapiju

Srodna testiranja

• HRD i BRCA analiza u tumoru
• Hematološki maligniteti (FoundationOne® Heme)
• Prognoza za karcinom dojke (MammaPrint® i BluePrint®)

Za većinu testova iz tkiva koristi se arhivirani parafinski blok iz ranije biopsije ili operacije. Prije slanja u inostranu laboratoriju uzorak prolazi lokalnu provjeru:

• Preuzimanje parafinskog bloka ili stakalaca iz bolničke patologije, uz vašu saglasnost.
• Histopatološka provjera adekvatnosti uzorka — udio i očuvanost tumorskih ćelija — u laboratoriji Precizna Dijagnostika u Sarajevu.
• Priprema stakalaca prema protokolu odabrane laboratorije i organizacija međunarodnog transporta.
• Ako tkivo nije adekvatno, procjenjujemo opciju tečne biopsije iz krvi.

• Precizna Dijagnostika
• Patološki nalaz — vrste informacija

Napomena: Somatsko profiliranje analizira promjene nastale u samom tumoru. Ukoliko sumnjate na nasljedni rizik od karcinoma, posjetite našu sekciju za nasljedni rizik od karcinoma.

Ovo je napredna medicina, ali ne smije obećavati ono što nijedan ozbiljan onkološki test ne može garantirati. Biomarker testiranje ne pronalazi uvijek metu. Ponekad tkivo nije adekvatno, ponekad se ne pronađe biomarker koji vodi ka dostupnoj terapiji, a nekada je terapija biološki smislena, ali nije praktično dostupna u regiji.

Upravo zato premium medicina ne prodaje iluziju sigurnosti. Ona nudi bolje i informiranije odluke u uslovima složene bolesti. To je stvarna vrijednost profiliranja – pametan, sljedeći korak zasnovan na biologiji vašeg tumora.

Pregled postojeće dokumentacije

Analiziramo vaš patohistološki nalaz, stadij bolesti, dosadašnju terapiju i ključno kliničko pitanje.

Odabir odgovarajuće platforme

Ovisno o kontekstu, biramo široki CGP pristup, tumor-specifični panel ili liquid biopsy. Odlučuje medicinska opravdanost, a ne najskuplji test po svaku cijenu.

Analiza uzorka

Koristi se arhivirano tumorsko tkivo (kockice/slajdovi) ili uzorak krvi.

Integrirani izvještaj

Ne dobijate sirovu listu mutacija, već strukturiran dokument koji vašem onkologu jasno razdvaja ono što ima terapijsku težinu od običnih bioloških varijacija.

Klinička interpretacija

Prava vrijednost testa je u njegovom pravilnom povezivanju sa vašom dijagnozom i realno dostupnim opcijama liječenja.

Da li je patohistološki nalaz isto što i profiliranje tumora?

Ne. Patohistološki nalaz potvrđuje dijagnozu i opisuje tip tumora pod mikroskopom. Profiliranje tumora analizira genetske promjene u tumorskim ćelijama i odgovara na pitanje koje ciljane terapije ili imunoterapija imaju biološku osnovu.

Šta ako u arhivskom bloku nema dovoljno tumorskog tkiva?

Tada se razmatra tečna biopsija iz krvi, koja analizira cirkulirajuću tumorsku DNK, ili nova biopsija ako je klinički opravdana i sigurna. Adekvatnost tkiva provjeravamo prije naručivanja testa.

Može li se koristiti tkivo iz operacije urađene ranije?

Najčešće da. Arhivski parafinski blokovi se u pravilu mogu koristiti i nakon više mjeseci ili godina, ali je kod uznapredovale bolesti ili nakon terapije ponekad korisniji noviji uzorak ili analiza iz krvi.

Koliko traje analiza i ko tumači nalaz?

Nakon prijema uzorka u laboratoriju nalaz je obično gotov za dvije do tri sedmice, zavisno od testa. Nalaz se dostavlja onkologu, a mi pomažemo u njegovom tumačenju u kontekstu dijagnoze i dostupnih terapija.

Šta ako test ne pronađe promjenu za koju postoji lijek?

I takav nalaz ima vrijednost: može isključiti terapije koje vjerovatno ne bi djelovale, ukazati na kliničke studije ili usmjeriti dalji standardni tretman.

Imate potvrđen karcinom i želite precizniji izbor terapije? Pošaljite nam svoj patohistološki nalaz i medicinsku dokumentaciju na besplatnu inicijalnu procjenu. Na osnovu kliničkog konteksta savjetovat ćemo vas da li najviše smisla ima sveobuhvatno genomsko profiliranje, specifični panel ili tečna biopsija.

Somatski paneli s kliničkom interpretacijom

• CeGaT CancerPrecision® — somatski tumorski panel za podršku odluci o terapiji; varijanta „Double Best“ paralelno analizira FFPE tkivo i tečnu biopsiju.
• CancerFusionRx® — RNK analiza fuzijskih transkripata, samostalno ili kao dodatak DNK panelu.
• CancerIFP — multipleks imunofluorescentno bojenje tumorskog mikrookruženja.
• Analiza ekspresije gena kao dodatak profiliranju.
• CancerAdvice® — detaljna pisana preporuka za terapiju na osnovu dobijenog molekularnog nalaza.

Široki paneli i integrirane analize

• Panel 511 gena za procjenu ciljane terapije i imunoterapije.
• Panel 161 gena i sveobuhvatni panel 395 gena s TMB, MSI i PD-L1 statusom.
• Panel 638 gena uz dodatne biomarkere MSI, TMB i HRD.
• Sekvenciranje cijelog transkriptoma kada standardni paneli ne objasne kliničku sliku.
• Integrirana analiza tkiva i krvi uz funkcionalno testiranje osjetljivosti na lijekove.

Analiza neoantigena (CancerNeo®)

Za pacijente kod kojih se razmatraju individualizirani imunoterapijski pristupi dostupna je analiza neoantigena na osnovu profila tumora i normalnog tkiva.