Epilepsija i poremećaji razvoja mozga
Analiza svih poznatih gena povezanih s epilepsijom i poremećajima razvoja mozga
Ljudski mozak sadrži gotovo 100 milijardi neurona i približno isto toliko neneuronskih ćelija. Izuzetno je složen i sposoban za najkompleksnije funkcije. Promjene u fiziologiji neurona — na primjer zbog defekata jonskih kanala ili poremećaja neuronske migracije — mogu voditi do teških bolesti, uključujući epileptičke encefalopatije. Epilepsija također može biti direktna posljedica strukturne abnormalnosti mozga. Zbog toga dijagnostički panel uključuje i sve poznate gene povezane s malformacijama mozga, neovisno o tome je li opisan napadni poremećaj.
Dijagnostički panel za epilepsiju i poremećaje razvoja mozga obuhvata 652 gena i zasnovan je na vlasničkoj ExomeXtra® tehnologiji obogaćivanja visokog kvaliteta koja pokriva sve regije koje kodiraju proteine, kao i intronske i intergenske varijante opisane kao relevantne za bolest u bazama podataka HGMD i ClinVar. Dodatno, ExomeXtra® omogućava CNV detekciju na nivou cijelog genoma s performansama sličnim array CGH-u, što predstavlja idealnu osnovu za genetsku dijagnostiku.
Šta nudimo panelom za epilepsiju i poremećaje razvoja mozga
Redovno ažuriranje
Izbor gena se redovno prilagođava aktuelnim naučnim saznanjima.
Fleksibilnost
Uz ExomeXtra® moguće je kombinovati genske setove koji pokrivaju različite bolesti.
Detaljan medicinski nalaz
Uključuje ACMG kriterije korištene za klasifikaciju varijanti.
Najviši kvalitet
Svi koraci analize izvode se u vlastitoj laboratoriji.
Naša obećanja
Brz rok izrade
Tipično 3–4 sedmice nakon prijema uzorka.
Sigurnost
Najviši standardi povjerljivosti i kvaliteta.
Pouzdanost
Pouzdana podrška kroz sve korake procesa.
Razumljivost
Jasno i pregledno pripremljen medicinski nalaz.
Vaše prednosti
Moguće je naručiti jedan ili više predefiniranih genskih setova. Pored kompletne analize gena naručenog seta, analizu proširujemo dodatnim genima za diferencijalnu dijagnozu. Za primarno naručeni set prijavljujemo varijante nepoznatog značaja (ACMG klasa 3) te patogene i vjerovatno patogene varijante (ACMG klase 4 i 5). Za gene uključene zbog diferencijalne dijagnoze izvještavanje je ograničeno na patogene i vjerovatno patogene varijante (klase 4 i 5) koje mogu biti povezane s indikacijom pacijenta.
Budući da je panel zasnovan na ExomeXtra® obogaćivanju, bez dodatnog sekvenciranja mogu se naručiti i fenotipski relevantni genski setovi iz drugih panela ili pojedinačni geni; na zahtjev je moguće sastaviti i individualni panel. Uz primarnu dijagnostičku narudžbu moguće je zatražiti i HLA tipizaciju, analizu ACMG gena te farmakogenetsko profiliranje.
Genski setovi — epilepsija
Familijarna i idiopatska epilepsija (EPI01, 36 gena)
ATP6V0C, CACNA1A, CHRNA2, CHRNA4, CHRNB2, DEPDC5, GABRA1, GABRB3, GABRG2, GNAO1, GRIN2A, HCN1, HCN2, KCNA1, KCNMA1, KCNQ2, KCNQ3, KCNT1, LGI1, MTOR, NPRL2, NPRL3, PCDH19, PRRT2, RELN, RORB, SCN1A, SCN1B, SCN2A, SCN3A, SCN8A, SLC2A1, SLC32A1, STX1B, TBC1D24, USP25
Epileptička encefalopatija (EPI02, 156 gena)
AARS1, ABAT, ACTL6B, ADAM22, ALDH7A1, ALG13, AMT, AP3B2, ARHGEF9, ARV1, ARX, ATP1A2, ATP1A3, ATP6V0A1, ATP6V0C, ATP6V1A, CACNA1A, CACNA1B, CACNA1E, CAD, CDK19, CDKL5, CELF2, CHD2, CLCN4, CNPY3, CNTNAP2, CPLX1, CSNK2B, CUX2, CYFIP2, DALRD3, DENND5A, DEPDC5, DMXL2, DNM1, DOCK7, EEF1A2, FBXO28, FGF12, FGF13, FOLR1, FOXG1, FRRS1L, FZR1, GABBR2, GABRA1, GABRA2, GABRA5, GABRB1, GABRB2, GABRB3, GABRG2, GAD1, GAMT, GLDC, GLS, GLUL, GNAO1, GOT2, GRIN1, GRIN2A, GRIN2B, GRIN2D, GUF1, HCN1, HNRNPU, IQSEC2, ITPA, KCNA2, KCNA3, KCNB1, KCNC2, KCNH5, KCNQ2, KCNQ5, KCNT1, KCNT2, LGI1, MAST3, MBD5, MDH1, MDH2, MECP2, MEF2C, MOCS1, MOCS2, NAPB, NCDN, NECAP1, NEUROD2, NEXMIF, NTRK2, NUS1, PACS2, PARS2, PCDH19, PHACTR1, PIGA, PIGB, PIGP, PIGQ, PIGS, PLCB1, PLPBP, PNKP, PNPO, POLG, PPP3CA, PTPN23, RHOBTB2, RNF13, ROGDI, SCN1A, SCN1B, SCN2A, SCN3A, SCN8A, SETD1B, SIK1, SLC12A5, SLC13A5, SLC1A2, SLC25A12, SLC25A22, SLC2A1, SLC32A1, SLC35A2, SLC38A3, SLC6A1, SLC6A8, SMC1A, SNAP25, SPTAN1, ST3GAL3, ST3GAL5, STXBP1, SV2A, SYNGAP1, SYNJ1, SZT2, TBC1D24, TBL1XR1, TCF4, TMEM63B, TRAK1, TSC1, TSC2, UBA5, UBE3A, UFSP2, UGDH, UGP2, WWOX, YWHAG, ZEB2
Progresivna mioklona epilepsija (EPI05, 17 gena)
AFG3L2, ASAH1, CERS1, CSTB, EPM2A, GOSR2, KCNC1, KCTD7, LMNB2, NEU1, NHLRC1, PRDM8, PRICKLE1, SCARB2, SEMA6B, SERPINI1, SLC7A6OS
Napomena: analiza CSTB repeticija je opcionalna. Najčešća patogena promjena u genu CSTB je ekspanzija dodekamerne repeticije u promotorskoj regiji (povezana s Unverricht-Lundborgovom bolešću, sporo progresivnom mioklonom epilepsijom).
Neuronalna ceroidna lipofuscinoza (EPI06)
Ovaj set naručuje se u okviru panela za neurodegenerativne bolesti, genski set NDD21.
Migrena (EPI14, 8 gena)
ATP1A2, ATP1A3, CACNA1A, NOTCH3, PRRT2, SCN1A, SLC1A3, SLC2A1
Genski setovi — poremećaji razvoja mozga
Mikrocefalija (BRN01, 164 gena)
AARS1, ADARB1, AFG2B, ANKLE2, ARPC4, ASPM, ATP1A2, ATP6V0A1, ATP6V0C, ATR, ATRX, BLM, BPTF, BUB1, BUB1B, CAMSAP1, CASK, CCDC88A, CDK5RAP2, CDT1, CENPF, CEP135, CEP152, CEP295, CEP57, CEP63, CHKA, CHMP1A, CIT, CKAP2L, COASY, CPAP, CREBBP, CTNNB1, CTU2, DDX11, DHCR7, DIAPH1, DNA2, DNMT3A, DOHH, DONSON, DYNC1I2, DYRK1A, EFTUD2, EIF2S3, EIF5A, ERCC6, ERCC8, FOXG1, FRA10AC1, GINS3, GMNN, GPT2, GRM7, H4C3, HDAC8, HHAT, IER3IP1, IGF1, IGF1R, INTS11, KIF11, KIF14, KIFBP, KMT2B, KNL1, LAGE3, LARP7, LIG4, LMNB1, LMNB2, MCPH1, MECP2, METTL5, MFSD2A, MINPP1, MORC2, NAPB, NARS1, NBN, NCAPD2, NCAPD3, NCAPH, NDE1, NHEJ1, NIPBL, NSD2, NUP107, NUP188, ORC1, ORC4, ORC6, OSGEP, PCDH12, PCNT, PDCD6IP, PLK4, PNKP, POC1A, PPFIBP1, PPIL1, PPP1R15B, PQBP1, PRIM1, PRUNE1, PTPN23, PUF60, PUS7, RAD21, RAD50, RARS2, RBBP8, RNU4-2, RNU4ATAC, RPL10, RRP7A, RTTN, SARS1, SASS6, SLC1A4, SLC25A19, SLC38A3, SLC4A10, SLC9A6, SLF2, SMC1A, SMC3, SMC5, SMG8, STAMBP, STIL, SVBP, TMX2, TOP3A, TP53RK, TRAIP, TRAPPC10, TRAPPC12, TRAPPC4, TRAPPC6B, TRAPPC9, TRIO, TRMT10A, TSEN15, TSEN54, TTC5, TTI1, TUBGCP2, TUBGCP4, TUBGCP6, UBA5, UFC1, UFM1, VRK1, WDR11, WDR4, WDR62, WDR73, WLS, XRCC4, YIPF5, ZEB2, ZNF335
Poremećaji neuronske migracije (BRN02, 81 gen)
ACTB, ACTG1, ADGRG1, AKT3, APC2, ARF1, ARFGEF2, ARX, B3GALNT2, B4GAT1, CAMSAP1, CASP2, CCND2, CDK5, CEP85L, COL3A1, COL4A1, COL4A2, CRADD, CRPPA, CTNNA2, DAG1, DCX, DYNC1H1, ERMARD, FAT4, FKRP, FKTN, FLNA, GMPPB, GRIN1, GRIN2B, KATNB1, KIF26A, KIF2A, KIF5C, KIFBP, LAMB1, LAMC3, LARGE1, MACF1, MAP1B, MAST1, NDE1, NEDD4L, OCLN, PAFAH1B1, PI4KA, PIDD1, PIK3CA, PIK3R2, POMGNT1, POMGNT2, POMK, POMT1, POMT2, PRUNE1, RAB18, RAB3GAP1, RAB3GAP2, RAC3, RELN, RTTN, RXYLT1, SNAP29, STAT2, TBC1D20, TMTC3, TSC1, TSC2, TUBA1A, TUBA8, TUBB, TUBB2A, TUBB2B, TUBB3, TUBG1, TUBGCP2, VLDLR, WDR62, WDR81
Holoprozencefalija (BRN03, 21 gen)
CDON, CENPF, CNOT1, DHCR7, DISP1, DLL1, FGF8, FGFR1, GLI2, KMT2D, PLCH1, PPP1R12A, PTCH1, RAD21, SHH, SIX3, SMC1A, STAG2, STIL, TGIF1, ZIC2
Makrocefalija (BRN04, 70 gena)
AKT1, AKT2, AKT3, APC2, ASPA, ASXL2, BRWD3, CCDC88C, CCND2, CDKN1C, CHD3, CHD4, CHD8, CRADD, DIS3L2, DNMT3A, EED, EXT2, EZH2, GCDH, GFAP, GLI3, GPC3, GPRC5B, H1-4, HEPACAM, HERC1, HRAS, HUWE1, KIF7, KPTN, L1CAM, MAX, MITF, MLC1, MPDZ, MTOR, MYCN, NF1, NFIA, NFIB, NFIX, NONO, NSD1, PAK1, PIGA, PIK3CA, PIK3R2, PPP1CB, PPP2CA, PPP2R1A, PPP2R5C, PPP2R5D, PTCH1, PTEN, RAB39B, RIN2, RNF125, SETD2, SOS1, STRADA, SUFU, SUZ12, TBC1D7, TRIM71, TRIO, UPF3B, WDFY3, ZBTB20, ZBTB7A
Leukodistrofija / leukoencefalopatija (BRN05, 100 gena)
AARS1, AARS2, ABCD1, ABHD16A, ACBD5, ACOX1, ADAR, AIFM1, AIMP1, AIMP2, ALDH3A2, AP4B1, ARSA, ASPA, BCAP31, CIC, CLCN2, CLDN11, CNTNAP1, COL4A1, CSF1R, CYP27A1, CYP7B1, DARS1, DARS2, DEGS1, EARS2, EIF2AK2, EIF2B1, EIF2B2, EIF2B3, EIF2B4, EIF2B5, ENTPD1, EPRS1, FA2H, GALC, GBE1, GFAP, GJC2, GPRC5B, HEPACAM, HIKESHI, HMBS, HPDL, HSD17B4, HSPD1, HTRA1, HYCC1, IFIH1, KARS1, L2HGDH, LMNB1, LSM11, MLC1, NAXD, NAXE, NKX6-2, NOTCH3, OCLN, PI4KA, PLAA, PLEKHG2, PLP1, POLR1C, POLR3A, POLR3B, POLR3K, PSAP, PYCR2, RAB11B, RARS1, RNASEH2A, RNASEH2B, RNASEH2C, RNASET2, RNF216, RNF220, RNU7-1, SAMHD1, SCP2, SLC16A2, SLC17A5, SLC25A12, SLC35B2, SNORD118, SOX10, SPG11, SUMF1, TMEM106B, TMEM163, TMEM63A, TREM2, TREX1, TUBB4A, TYROBP, UFM1, USP18, VPS11, ZFYVE26
Aicardi-Goutières sindrom (BRN06)
Uključen je u genski set AID07 u okviru panela za imunološke bolesti.
Joubertov sindrom (BRN07, 44 gena)
AHI1, ARL13B, ARL3, ARMC9, B9D1, B9D2, C2CD3, CC2D2A, CEP104, CEP120, CEP290, CEP41, CPLANE1, CSPP1, FAM149B1, HYLS1, IFT172, IFT74, INPP5E, KATNIP, KIAA0586, KIAA0753, KIF7, MKS1, NPHP1, NPHP4, OFD1, PDE6D, PIBF1, RPGRIP1L, SUFU, TCTN1, TCTN2, TCTN3, TMEM107, TMEM138, TMEM216, TMEM218, TMEM231, TMEM237, TMEM67, TOGARAM1, TTC21B, ZNF423
RASopatije (uklj. Noonanov sindrom) (BRN10, 22 gena)
BRAF, CBL, HRAS, KRAS, LZTR1, MAP2K1, MAP2K2, MAPK1, MRAS, NF1, NRAS, PPP1CB, PTPN11, RAF1, RASA2, RIT1, RRAS2, SHOC2, SOS1, SOS2, SPRED1, SPRED2
Kabuki sindrom (BRN11, 3 gena)
CHD7, KDM6A, KMT2D
Coffin-Siris sindrom (BRN12, 14 gena)
ARID1A, ARID1B, ARID2, BICRA, DPF2, PHF6, SMARCA2, SMARCA4, SMARCB1, SMARCC2, SMARCD1, SMARCE1, SOX11, SOX4
Cornelia de Lange sindrom (BRN13, 7 gena)
ANKRD11, BRD4, HDAC8, NIPBL, RAD21, SMC1A, SMC3
Hiperekpleksija (BRN15, 4 gena)
ATAD1, GLRA1, GLRB, SLC6A5
Direktorij gena — panel za epilepsiju i poremećaje razvoja mozga
AARS1, AARS2, ABAT, ABCD1, ABHD16A, ACBD5, ACOX1, ACTB, ACTG1, ACTL6B, ADAM22, ADAR, ADARB1, ADGRG1, AFG2B, AFG3L2, AHI1, AIFM1, AIMP1, AIMP2, AKT1, AKT2, AKT3, ALDH3A2, ALDH7A1, ALG13, AMT, ANKLE2, ANKRD11, AP3B2, AP4B1, APC2, ARF1, ARFGEF2, ARHGEF9, ARID1A, ARID1B, ARID2, ARL13B, ARL3, ARMC9, ARPC4, ARSA, ARV1, ARX, ASAH1, ASPA, ASPM, ASXL2, ATAD1, ATP1A2, ATP1A3, ATP6V0A1, ATP6V0C, ATP6V1A, ATR, ATRX, B3GALNT2, B4GAT1, B9D1, B9D2, BCAP31, BICRA, BLM, BPTF, BRAF, BRD4, BRWD3, BUB1, BUB1B, C2CD3, CACNA1A, CACNA1B, CACNA1E, CAD, CAMSAP1, CASK, CASP2, CBL, CC2D2A, CCDC88A, CCDC88C, CCND2, CDK19, CDK5, CDK5RAP2, CDKL5, CDKN1C, CDON, CDT1, CELF2, CENPF, CEP104, CEP120, CEP135, CEP152, CEP290, CEP295, CEP41, CEP57, CEP63, CEP85L, CERS1, CHD2, CHD3, CHD4, CHD7, CHD8, CHKA, CHMP1A, CHRNA2, CHRNA4, CHRNB2, CIC, CIT, CKAP2L, CLCN2, CLCN4, CLDN11, CNOT1, CNPY3, CNTNAP1, CNTNAP2, COASY, COL3A1, COL4A1, COL4A2, CPAP, CPLANE1, CPLX1, CRADD, CREBBP, CRPPA, CSF1R, CSNK2B, CSPP1, CSTB, CTNNA2, CTNNB1, CTU2, CUX2, CYFIP2, CYP27A1, CYP7B1, DAG1, DALRD3, DARS1, DARS2, DCX, DDX11, DEGS1, DENND5A, DEPDC5, DHCR7, DIAPH1, DIS3L2, DISP1, DLL1, DMXL2, DNA2, DNM1, DNMT3A, DOCK7, DOHH, DONSON, DPF2, DYNC1H1, DYNC1I2, DYRK1A, EARS2, EED, EEF1A2, EFTUD2, EIF2AK2, EIF2B1, EIF2B2, EIF2B3, EIF2B4, EIF2B5, EIF2S3, EIF5A, ENTPD1, EPM2A, EPRS1, ERCC6, ERCC8, ERMARD, EXT2, EZH2, FA2H, FAM149B1, FAT4, FBXO28, FGF12, FGF13, FGF8, FGFR1, FKRP, FKTN, FLNA, FOLR1, FOXG1, FRA10AC1, FRRS1L, FZR1, GABBR2, GABRA1, GABRA2, GABRA5, GABRB1, GABRB2, GABRB3, GABRG2, GAD1, GALC, GAMT, GBE1, GCDH, GFAP, GINS3, GJC2, GLDC, GLI2, GLI3, GLRA1, GLRB, GLS, GLUL, GMNN, GMPPB, GNAO1, GOSR2, GOT2, GPC3, GPRC5B, GPT2, GRIN1, GRIN2A, GRIN2B, GRIN2D, GRM7, GUF1, H1-4, H4C3, HCN1, HCN2, HDAC8, HEPACAM, HERC1, HHAT, HIKESHI, HMBS, HNRNPU, HPDL, HRAS, HSD17B4, HSPD1, HTRA1, HUWE1, HYCC1, HYLS1, IER3IP1, IFIH1, IFT172, IFT74, IGF1, IGF1R, INPP5E, INTS11, IQSEC2, ITPA, KARS1, KATNB1, KATNIP, KCNA1, KCNA2, KCNA3, KCNB1, KCNC1, KCNC2, KCNH5, KCNMA1, KCNQ2, KCNQ3, KCNQ5, KCNT1, KCNT2, KCTD7, KDM6A, KIAA0586, KIAA0753, KIF11, KIF14, KIF26A, KIF2A, KIF5C, KIF7, KIFBP, KMT2B, KMT2D, KNL1, KPTN, KRAS, L1CAM, L2HGDH, LAGE3, LAMB1, LAMC3, LARGE1, LARP7, LGI1, LIG4, LMNB1, LMNB2, LSM11, LZTR1, MACF1, MAP1B, MAP2K1, MAP2K2, MAPK1, MAST1, MAST3, MAX, MBD5, MCPH1, MDH1, MDH2, MECP2, MEF2C, METTL5, MFSD2A, MINPP1, MITF, MKS1, MLC1, MOCS1, MOCS2, MORC2, MPDZ, MRAS, MTOR, MYCN, NAPB, NARS1, NAXD, NAXE, NBN, NCAPD2, NCAPD3, NCAPH, NCDN, NDE1, NECAP1, NEDD4L, NEU1, NEUROD2, NEXMIF, NF1, NFIA, NFIB, NFIX, NHEJ1, NHLRC1, NIPBL, NKX6-2, NONO, NOTCH3, NPHP1, NPHP4, NPRL2, NPRL3, NRAS, NSD1, NSD2, NTRK2, NUP107, NUP188, NUS1, OCLN, OFD1, ORC1, ORC4, ORC6, OSGEP, PACS2, PAFAH1B1, PAK1, PARS2, PCDH12, PCDH19, PCNT, PDCD6IP, PDE6D, PHACTR1, PHF6, PI4KA, PIBF1, PIDD1, PIGA, PIGB, PIGP, PIGQ, PIGS, PIK3CA, PIK3R2, PLAA, PLCB1, PLCH1, PLEKHG2, PLK4, PLP1, PLPBP, PNKP, PNPO, POC1A, POLG, POLR1C, POLR3A, POLR3B, POLR3K, POMGNT1, POMGNT2, POMK, POMT1, POMT2, PPFIBP1, PPIL1, PPP1CB, PPP1R12A, PPP1R15B, PPP2CA, PPP2R1A, PPP2R5C, PPP2R5D, PPP3CA, PQBP1, PRDM8, PRICKLE1, PRIM1, PRRT2, PRUNE1, PSAP, PTCH1, PTEN, PTPN11, PTPN23, PUF60, PUS7, PYCR2, RAB11B, RAB18, RAB39B, RAB3GAP1, RAB3GAP2, RAC3, RAD21, RAD50, RAF1, RARS1, RARS2, RASA2, RBBP8, RELN, RHOBTB2, RIN2, RIT1, RNASEH2A, RNASEH2B, RNASEH2C, RNASET2, RNF125, RNF13, RNF216, RNF220, RNU4-2, RNU4ATAC, RNU7-1, ROGDI, RORB, RPGRIP1L, RPL10, RRAS2, RRP7A, RTTN, RXYLT1, SAMHD1, SARS1, SASS6, SCARB2, SCN1A, SCN1B, SCN2A, SCN3A, SCN8A, SCP2, SEMA6B, SERPINI1, SETD1B, SETD2, SHH, SHOC2, SIK1, SIX3, SLC12A5, SLC13A5, SLC16A2, SLC17A5, SLC1A2, SLC1A3, SLC1A4, SLC25A12, SLC25A19, SLC25A22, SLC2A1, SLC32A1, SLC35A2, SLC35B2, SLC38A3, SLC4A10, SLC6A1, SLC6A5, SLC6A8, SLC7A6OS, SLC9A6, SLF2, SMARCA2, SMARCA4, SMARCB1, SMARCC2, SMARCD1, SMARCE1, SMC1A, SMC3, SMC5, SMG8, SNAP25, SNAP29, SNORD118, SOS1, SOS2, SOX10, SOX11, SOX4, SPG11, SPRED1, SPRED2, SPTAN1, ST3GAL3, ST3GAL5, STAG2, STAMBP, STAT2, STIL, STRADA, STX1B, STXBP1, SUFU, SUMF1, SUZ12, SV2A, SVBP, SYNGAP1, SYNJ1, SZT2, TBC1D20, TBC1D24, TBC1D7, TBL1XR1, TCF4, TCTN1, TCTN2, TCTN3, TGIF1, TMEM106B, TMEM107, TMEM138, TMEM163, TMEM216, TMEM218, TMEM231, TMEM237, TMEM63A, TMEM63B, TMEM67, TMTC3, TMX2, TOGARAM1, TOP3A, TP53RK, TRAIP, TRAK1, TRAPPC10, TRAPPC12, TRAPPC4, TRAPPC6B, TRAPPC9, TREM2, TREX1, TRIM71, TRIO, TRMT10A, TSC1, TSC2, TSEN15, TSEN54, TTC21B, TTC5, TTI1, TUBA1A, TUBA8, TUBB, TUBB2A, TUBB2B, TUBB3, TUBB4A, TUBG1, TUBGCP2, TUBGCP4, TUBGCP6, TYROBP, UBA5, UBE3A, UFC1, UFM1, UFSP2, UGDH, UGP2, UPF3B, USP18, USP25, VLDLR, VPS11, VRK1, WDFY3, WDR11, WDR4, WDR62, WDR73, WDR81, WLS, WWOX, XRCC4, YIPF5, YWHAG, ZBTB20, ZBTB7A, ZEB2, ZFYVE26, ZIC2, ZNF335, ZNF423
Metoda
Obogaćivanje kodirajućih i susjednih intronskih regija vrši se tehnologijom hibridizacije u otopini. Selekcija ciljanih regija i dizajn sondi izvode se interno. Sekvenciranje visokog protoka provodi se na Illumina platformama, a bioinformatička obrada podataka na vlastitom računarskom klasteru. Nakon obrade podataka, naš tim naučnika i specijalista humane genetike analizira rezultate i izdaje medicinski nalaz.
Dijagnostički proces
1.
Savjetovanje i odabir testa
Zajedno s vama i vašim ljekarom određujemo koji je genski set ili kombinacija setova najprikladnija za kliničku sliku.
2.
Uzorkovanje i slanje
Uzorak se uzima u našoj ustanovi ili kod uputnog ljekara i sigurno transportuje do laboratorije.
3.
Analiza uzorka
ExomeXtra® obogaćivanje, sekvenciranje visokog protoka i bioinformatička obrada uz detekciju CNV-a.
4.
Nalaz i savjetovanje
Detaljan medicinski nalaz s ACMG klasifikacijom varijanti i preporukama, uz mogućnost konsultacije.
Standardni zahtjevi za uzorak
- 1–2 ml EDTA krvi (preporučeni tip uzorka)
- Genomska DNK (1–2 µg)
- DBS kartice, bris obraza ili pljuvačka također su mogući
Dodatne usluge
- HLA tipizacija — HLA klasa I (geni A, B, C) i HLA klasa II (geni DPA1, DPB1, DQA1, DQB1, DRB1, DRB3, DRB4, DRB5)
- Analiza ACMG gena — izvještavanje o patogenim varijantama (klase 4 i 5) u odabranim genima za koje postoji preporučeni postupak liječenja ili praćenja (sekundarni nalazi)
- Farmakogenetska analiza (PGx) — analiza varijanti u genima uključenim u metabolizam lijekova, radi prilagođavanja terapije i smanjenja nuspojava
Često postavljana pitanja
Kome je namijenjen panel za epilepsiju i poremećaje razvoja mozga?
Panel je namijenjen pacijentima s epilepsijom nejasne etiologije, epileptičkim encefalopatijama, razvojnim zastojem, mikrocefalijom ili makrocefalijom, malformacijama mozga i leukodistrofijama, kao i osobama s pozitivnom porodičnom anamnezom.
Koliko traje izrada nalaza?
Nalaz se tipično izdaje 3–4 sedmice nakon prijema uzorka u laboratoriji.
Koliko gena obuhvata panel?
Panel obuhvata 652 gena, a moguće je naručiti pojedinačne genske setove (EPI01–EPI14, BRN01–BRN15) ili ih kombinovati sa setovima iz drugih panela bez dodatnog sekvenciranja.
Zašto je genetska dijagnoza epilepsije važna?
Genetska dijagnoza može direktno usmjeriti odabir antiepileptičke terapije (npr. kod defekata jonskih kanala ili deficita GLUT1), izbjeći nepotrebne pretrage, omogućiti procjenu prognoze i genetsko savjetovanje porodice.
Sljedeći korak
Niste sigurni da li je ovaj test pravi za vas?
Pošaljite nam medicinsku dokumentaciju ili zakažite konsultaciju — zajedno ćemo procijeniti koji test ima najviše kliničkog smisla.