Neuromuskularne bolesti

Redovno ažuriranje

Izbor gena se redovno prilagođava aktuelnim naučnim saznanjima.

Fleksibilnost

Uz ExomeXtra® moguće je kombinovati genske setove koji pokrivaju različite bolesti.

Detaljan medicinski nalaz

Uključuje ACMG kriterije korištene za klasifikaciju varijanti.

Najviši kvalitet

Svi koraci analize izvode se u vlastitoj laboratoriji.

Brz rok izrade

Tipično 3–4 sedmice nakon prijema uzorka.

Sigurnost

Najviši standardi povjerljivosti i kvaliteta.

Pouzdanost

Pouzdana podrška kroz sve korake procesa.

Razumljivost

Jasno i pregledno pripremljen medicinski nalaz.

Moguće je naručiti jedan ili više predefiniranih genskih setova. Pored kompletne analize gena naručenog seta, analizu proširujemo dodatnim genima relevantnim za diferencijalnu dijagnozu. Za primarno naručeni set prijavljujemo varijante nepoznatog značaja (ACMG klasa 3), kao i vjerovatno patogene i patogene varijante (klase 4 i 5), dok se za dodatne gene prijavljuju samo varijante klase 4 i 5 povezane s indikacijom.

Budući da je panel zasnovan na ExomeXtra® obogaćivanju, bez dodatnog sekvenciranja mogu se naručiti i fenotipski relevantni genski setovi iz drugih panela ili pojedinačni geni; na zahtjev je moguće sastaviti i individualni panel. Uz primarnu dijagnostičku narudžbu opcionalno se mogu naručiti HLA tipizacija, analiza ACMG gena i farmakogenetsko profiliranje.

Spinalne mišićne atrofije (NMD01, 28 gena)

• ASAH1
• ASCC1
• ATP7A
• BICD2
• BSCL2
• CHCHD10
• COQ7
• DCTN1
• DNAJB2
• DYNC1H1
• EMILIN1
• FBXO38
• GARS1
• HSPB1
• HSPB8
• IGHMBP2
• LAS1L
• PLEKHG5
• REEP1
• SLC5A7
• SPTAN1
• SYT2
• TRIP4
• TRPV4
• UBA1
• VAPB
• VRK1
• WARS1

Kao prva linija analize provodi se delecijsko/duplikacijska analiza gena SMN1 i SMN2. Rezultat za SMN2 dostavlja se u slučajevima kada je dokazana delecija SMN1. Analiza SMN1/SMN2 može se isključiti ako nije potrebna. Analiza AR-repeticija je opcionalna.

Nasljedne neuropatije (NMD02, 99 gena)

• AARS1
• ABHD12
• AIFM1
• ARHGEF10
• ATL1
• ATL3
• ATP1A1
• ATP7B
• BSCL2
• CADM3
• COX6A1
• DNAJB2
• DNM2
• DNMT1
• DST
• DYNC1H1
• EGR2
• ELP1
• FBLN5
• FGD4
• FIG4
• GAN
• GARS1
• GBF1
• GDAP1
• GJB1
• GLA
• GNB4
• GSN
• HADHA
• HADHB
• HARS1
• HINT1
• HK1
• HSPB1
• HSPB8
• IGHMBP2
• INF2
• ITPR3
• JAG1
• KIF1A
• KIF1B
• KIF5A
• LITAF
• LMNA
• LRSAM1
• MARS1
• MCM3AP
• MFN2
• MME
• MORC2
• MPV17
• MPZ
• MTMR2
• NDRG1
• NEFH
• NEFL
• NGF
• NTRK1
• NUDT2
• PDK3
• PDXK
• PLAAT3
• PLEKHG5
• PMP2
• PMP22
• POLG
• POLR3B
• PRDM12
• PRPS1
• PRX
• RAB7A
• REEP1
• RETREG1
• SBF1
• SBF2
• SCN9A
• SCN10A
• SCN11A
• SH3TC2
• SLC5A6
• SLC12A6
• SORD
• SPG11
• SPTAN1
• SPTLC1
• SPTLC2
• SURF1
• TFG
• TRIM2
• TRPA1
• TRPV4
• TTR
• VCP
• VWA1
• WARS1
• WNK1
• YARS1
• ZFHX2

Kao prva linija analize provodi se delecijsko/duplikacijska analiza gena PMP22, koja se može isključiti ako nije potrebna. Set pokriva nasljedne motoričke i senzorne neuropatije, uključujući oblike bolesti Charcot-Marie-Tooth.

Kongenitalne i distalne miopatije (NMD03, 84 gena)

• ABCC9
• ACTA1
• ACTN2
• ADSS1
• ANO5
• BAG3
• BIN1
• CACNA1S
• CASQ1
• CAV3
• CCDC78
• CFL2
• CNTN1
• COL6A1
• COL6A2
• COL6A3
• COL12A1
• COX6A2
• CRYAB
• DES
• DMD
• DNA2
• DNAJB4
• DNAJB6
• DNM2
• DYSF
• FHL1
• FLNC
• FXR1
• GNE
• HACD1
• KBTBD13
• KLHL40
• KLHL41
• KY
• LDB3
• LMOD3
• MAP3K20
• MATR3
• MB
• MEGF10
• MICU1
• MLIP
• MSTO1
• MTM1
• MTMR14
• MYBPC1
• MYH2
• MYH7
• MYL1
• MYL2
• MYO18B
• MYOD1
• MYOT
• MYPN
• NEB
• ORAI1
• PAX7
• POLG
• POLG2
• PYROXD1
• RYR1
• RYR3
• SCN4A
• SELENON
• SLC5A6
• SMPX
• SPEG
• SQSTM1
• STAC3
• STIM1
• SVIL
• TCAP
• TIA1
• TK2
• TNNC2
• TNNT1
• TOR1AIP1
• TPM2
• TPM3
• TTN
• UNC45B
• VCP
• VWA1

Set obuhvata kongenitalne miopatije (npr. nemalinsku, centronuklearnu i miopatiju s centralnim jezgrama) te distalne miopatije s pretežnom slabošću distalne muskulature.

Mišićne distrofije pojasnog tipa (NMD04, 43 gena)

• ADSS1
• ANO5
• BVES
• CAPN3
• CAV3
• COL6A1
• CRPPA
• DAG1
• DES
• DMD
• DNAJB6
• DNM2
• DPM3
• DYSF
• FKRP
• FKTN
• FLNC
• GMPPB
• HMGCR
• HNRNPDL
• JAG2
• LAMA2
• LIMS2
• LMNA
• MYOT
• PLEC
• POGLUT1
• POMGNT1
• POMGNT2
• POMK
• POMT1
• POMT2
• POPDC3
• PYROXD1
• SGCA
• SGCB
• SGCD
• SGCG
• TCAP
• TNPO3
• TRAPPC11
• TRIM32
• TTN

Mišićne distrofije pojasnog tipa (LGMD) karakteriše progresivna slabost mišića ramenog i karličnog pojasa; klinički se oblici često preklapaju pa je genetska potvrda ključna za dijagnozu i praćenje.

Ostale mišićne distrofije (NMD05, 33 gena)

• ANO5
• CAV3
• CAVIN1
• CHKB
• COL12A1
• COL6A1
• COL6A2
• COL6A3
• DMD
• DYSF
• EMD
• FHL1
• FKRP
• FKTN
• GGPS1
• GMPPB
• GOSR2
• HNRNPA2B1
• INPP5K
• ITGA7
• LAMA2
• LARGE1
• LMNA
• PABPN1
• POMGNT1
• POMT1
• POMT2
• PYROXD1
• SYNE1
• SYNE2
• TMEM43
• TOR1AIP1
• TTN

Set obuhvata Duchenneovu i Beckerovu mišićnu distrofiju, kongenitalne mišićne distrofije, Emery-Dreifussovu distrofiju i okulofaringealnu mišićnu distrofiju.

Miotonije (NMD07, 5 gena)

• ATP2A1
• CAV3
• CLCN1
• HINT1
• SCN4A

Nedistrofične miotonije nastaju zbog poremećaja funkcije jonskih kanala mišićne membrane i karakteriše ih otežano opuštanje mišića nakon kontrakcije.

Metaboličke miopatije (NMD08, 49 gena)

• ACAD9
• ACADM
• ACADS
• ACADVL
• AGL
• ALDOA
• AMPD1
• CPT2
• ENO3
• ETFA
• ETFB
• ETFDH
• FDX2
• FLAD1
• GAA
• GBE1
• GYG1
• GYS1
• HADHA
• HADHB
• ISCU
• LAMP2
• LDHA
• LPIN1
• MGME1
• PFKM
• PGAM2
• PGK1
• PGM1
• PHKA1
• PHKB
• PHKG2
• PNPLA2
• POLG
• POLG2
• PUS1
• PYGM
• RBCK1
• RRM2B
• SLC16A1
• SLC22A5
• SLC25A4
• SLC25A20
• SLC25A42
• SUCLA2
• TAFAZZIN
• VDR
• VMA21
• YARS2

Metaboličke miopatije nastaju zbog poremećaja metabolizma glikogena, masnih kiselina ili mitohondrijske energetske proizvodnje (npr. Pompeova bolest, McArdleova bolest, deficijencija CPT2). Tipični simptomi su nepodnošenje napora, mišićni grčevi, rabdomioliza i progresivna slabost.

Distroglikanopatije / Walker-Warburg sindrom (NMD10, 14 gena)

• B3GALNT2
• B4GAT1
• CRPPA
• DAG1
• FKRP
• FKTN
• GMPPB
• LARGE1
• POMGNT1
• POMGNT2
• POMK
• POMT1
• POMT2
• RXYLT1

Distroglikanopatije nastaju zbog poremećaja glikozilacije α-distroglikana i obuhvataju spektar od teških kongenitalnih oblika sa zahvatanjem mozga i oka (Walker-Warburg sindrom, mišićno-očno-moždana bolest) do blažih distrofija pojasnog tipa.

Periodične paralize (NMD12, 6 gena)

• ATP1A2
• CACNA1S
• KCNJ2
• KCNJ5
• RYR1
• SCN4A

Periodične paralize su kanalopatije s epizodama slabosti mišića, često povezanim s promjenama nivoa kalija; genetska dijagnoza usmjerava profilaksu i izbor terapije.

Kongenitalni mijastenički sindromi (NMD13, 24 gena)

• AGRN
• ALG14
• ALG2
• CHAT
• CHRNA1
• CHRNB1
• CHRND
• CHRNE
• COL13A1
• COLQ
• DOK7
• DPAGT1
• GFPT1
• MUSK
• MYO9A
• PREPL
• RAPSN
• SCN4A
• SLC18A3
• SLC5A7
• SLC25A1
• SNAP25
• SYT2
• VAMP1

Kongenitalni mijastenički sindromi nastaju zbog poremećaja prijenosa signala na neuromišićnoj spojnici. Genetski podtip direktno određuje izbor terapije, jer pojedini lijekovi kod određenih oblika mogu pogoršati simptome.

Kongenitalne kontrakture i artrogripoza (NMD14, 52 gena)

• ACTA1
• ADAMTS15
• ADCY6
• ADGRG6
• ASCC1
• BICD2
• CHRND
• CHRNG
• CHST14
• CNTNAP1
• DNM2
• DOK7
• ECEL1
• FBN2
• FILIP1
• FKBP10
• GLDN
• GLE1
• KLHL40
• KLHL41
• LGI4
• MAGEL2
• MUSK
• MYBPC1
• MYH3
• MYH8
• MYL11
• MYOD1
• NALCN
• NEB
• NEK9
• NUP88
• PIEZO2
• PIP5K1C
• PLOD2
• RAPSN
• RYR1
• SCYL2
• SLC18A3
• SLC35A3
• SYNE1
• TNNI2
• TNNT3
• TOR1A
• TPM2
• TRIP4
• TRPV4
• TTN
• UBA1
• VIPAS39
• VPS33B
• ZC4H2

Artrogripoza označava prisustvo višestrukih kongenitalnih kontraktura zglobova, često zbog smanjenih pokreta ploda uslijed neuromuskularnog poremećaja. Genetska dijagnoza pomaže u procjeni prognoze i savjetovanju porodice.

• AARS1
• ABCC9
• ABHD12
• ACAD9
• ACADM
• ACADS
• ACADVL
• ACTA1
• ACTN2
• ADAMTS15
• ADCY6
• ADGRG6
• ADSS1
• AGL
• AGRN
• AIFM1
• ALDOA
• ALG14
• ALG2
• AMPD1
• ANO5
• ARHGEF10
• ASAH1
• ASCC1
• ATL1
• ATL3
• ATP1A1
• ATP1A2
• ATP2A1
• ATP7A
• ATP7B
• B3GALNT2
• B4GAT1
• BAG3
• BICD2
• BIN1
• BSCL2
• BVES
• CACNA1S
• CADM3
• CAPN3
• CASQ1
• CAV3
• CAVIN1
• CCDC78
• CFL2
• CHAT
• CHCHD10
• CHKB
• CHRNA1
• CHRNB1
• CHRND
• CHRNE
• CHRNG
• CHST14
• CLCN1
• CNTN1
• CNTNAP1
• COL12A1
• COL13A1
• COL6A1
• COL6A2
• COL6A3
• COLQ
• COQ7
• COX6A1
• COX6A2
• CPT2
• CRPPA
• CRYAB
• DAG1
• DCTN1
• DES
• DMD
• DNA2
• DNAJB2
• DNAJB4
• DNAJB6
• DNM2
• DNMT1
• DOK7
• DPAGT1
• DPM3
• DST
• DYNC1H1
• DYSF
• ECEL1
• EGR2
• ELP1
• EMD
• EMILIN1
• ENO3
• ETFA
• ETFB
• ETFDH
• FBLN5
• FBN2
• FBXO38
• FDX2
• FGD4
• FHL1
• FIG4
• FILIP1
• FKBP10
• FKRP
• FKTN
• FLAD1
• FLNC
• FXR1
• GAA
• GAN
• GARS1
• GBE1
• GBF1
• GDAP1
• GFPT1
• GGPS1
• GJB1
• GLA
• GLDN
• GLE1
• GMPPB
• GNB4
• GNE
• GOSR2
• GSN
• GYG1
• GYS1
• HACD1
• HADHA
• HADHB
• HARS1
• HINT1
• HK1
• HMGCR
• HNRNPA2B1
• HNRNPDL
• HSPB1
• HSPB8
• IGHMBP2
• INF2
• INPP5K
• ISCU
• ITGA7
• ITPR3
• JAG1
• JAG2
• KBTBD13
• KCNJ2
• KCNJ5
• KIF1A
• KIF1B
• KIF5A
• KLHL40
• KLHL41
• KY
• LAMA2
• LAMP2
• LARGE1
• LAS1L
• LDB3
• LDHA
• LGI4
• LIMS2
• LITAF
• LMNA
• LMOD3
• LPIN1
• LRSAM1
• MAGEL2
• MAP3K20
• MARS1
• MATR3
• MB
• MCM3AP
• MEGF10
• MFN2
• MGME1
• MICU1
• MLIP
• MME
• MORC2
• MPV17
• MPZ
• MSTO1
• MTM1
• MTMR14
• MTMR2
• MUSK
• MYBPC1
• MYH2
• MYH3
• MYH7
• MYH8
• MYL1
• MYL11
• MYL2
• MYO18B
• MYO9A
• MYOD1
• MYOT
• MYPN
• NALCN
• NDRG1
• NEB
• NEFH
• NEFL
• NEK9
• NGF
• NTRK1
• NUDT2
• NUP88
• ORAI1
• PABPN1
• PAX7
• PDK3
• PDXK
• PFKM
• PGAM2
• PGK1
• PGM1
• PHKA1
• PHKB
• PHKG2
• PIEZO2
• PIP5K1C
• PLAAT3
• PLEC
• PLEKHG5
• PLOD2
• PMP2
• PMP22
• PNPLA2
• POGLUT1
• POLG
• POLG2
• POLR3B
• POMGNT1
• POMGNT2
• POMK
• POMT1
• POMT2
• POPDC3
• PRDM12
• PREPL
• PRPS1
• PRX
• PUS1
• PYGM
• PYROXD1
• RAB7A
• RAPSN
• RBCK1
• REEP1
• RETREG1
• RRM2B
• RXYLT1
• RYR1
• RYR3
• SBF1
• SBF2
• SCN10A
• SCN11A
• SCN4A
• SCN9A
• SCYL2
• SELENON
• SGCA
• SGCB
• SGCD
• SGCG
• SH3TC2
• SLC12A6
• SLC16A1
• SLC18A3
• SLC22A5
• SLC25A1
• SLC25A20
• SLC25A4
• SLC25A42
• SLC35A3
• SLC5A6
• SLC5A7
• SMPX
• SNAP25
• SORD
• SPEG
• SPG11
• SPTAN1
• SPTLC1
• SPTLC2
• SQSTM1
• STAC3
• STIM1
• SUCLA2
• SURF1
• SVIL
• SYNE1
• SYNE2
• SYT2
• TAFAZZIN
• TCAP
• TFG
• TIA1
• TK2
• TMEM43
• TNNC2
• TNNI2
• TNNT1
• TNNT3
• TNPO3
• TOR1A
• TOR1AIP1
• TPM2
• TPM3
• TRAPPC11
• TRIM2
• TRIM32
• TRIP4
• TRPA1
• TRPV4
• TTN
• TTR
• UBA1
• UNC45B
• VAMP1
• VAPB
• VCP
• VDR
• VIPAS39
• VMA21
• VPS33B
• VRK1
• VWA1
• WARS1
• WNK1
• YARS1
• YARS2
• ZC4H2
• ZFHX2

Obogaćivanje kodirajućih i susjednih intronskih regija vrši se tehnologijom hibridizacije u otopini. Selekcija ciljanih regija i dizajn sondi izvode se interno. Sekvenciranje se provodi na Illumina platformama, a bioinformatička obrada, detekcija CNV-a i medicinska interpretacija u potpunosti se rade u vlastitoj laboratoriji.

1.

Savjetovanje i odabir testa

Zajedno s vama i vašim neurologom ili pedijatrom određujemo koji je genski set ili kombinacija setova najprikladnija za kliničku sliku.

2.

Uzorkovanje i slanje

Uzorak se uzima u našoj ustanovi ili kod uputnog ljekara i sigurno transportuje do laboratorije.

3.

Analiza uzorka

ExomeXtra® obogaćivanje, sekvenciranje visokog protoka i bioinformatička obrada uz detekciju CNV-a, te po potrebi analiza SMN1/SMN2 i PMP22.

4.

Nalaz i savjetovanje

Detaljan medicinski nalaz s ACMG klasifikacijom varijanti i preporukama, uz mogućnost konsultacije.

• 1–2 ml EDTA krvi (preporučeni tip uzorka)
• Genomska DNK (1–2 µg)
• DBS kartice, bris obraza ili pljuvačka također su mogući

• HLA tipizacija — HLA klasa I (geni A, B, C) i HLA klasa II (geni DPA1, DPB1, DQA1, DQB1, DRB1, DRB3, DRB4, DRB5)
• Analiza ACMG gena — izvještavanje o patogenim varijantama (klase 4 i 5) u odabranim genima za koje postoji preporučeni postupak liječenja ili praćenja (sekundarni nalazi)
• Farmakogenetska analiza (PGx) — analiza varijanti u genima uključenim u metabolizam lijekova, radi prilagođavanja terapije i smanjenja nuspojava

Kome je namijenjen panel za neuromuskularne bolesti?

Panel je namijenjen djeci i odraslima sa sumnjom na nasljednu bolest mišića ili perifernih nerava — npr. progresivna mišićna slabost, hipotonija u dojenačkom periodu, povišen CK, polineuropatija, miotonija, epizodne paralize ili višestruke kongenitalne kontrakture — te članovima porodice osoba s poznatom patogenom varijantom.

Koliko traje izrada nalaza?

Nalaz se tipično izdaje 3–4 sedmice nakon prijema uzorka u laboratoriji.

Koji uzorak je potreban?

Preporučeno je 1–2 ml EDTA krvi. Mogući su i izolirana genomska DNK (1–2 µg), DBS kartice, bris obraza ili pljuvačka.

Da li panel obuhvata analizu gena SMN1 i SMN2?

Da. Kod seta NMD01 (spinalne mišićne atrofije) kao prva linija analize provodi se delecijsko/duplikacijska analiza gena SMN1, a rezultat za SMN2 dostavlja se kada je dokazana delecija SMN1. Analiza se može isključiti ako nije potrebna. Kod seta NMD02 kao prva linija provodi se analiza gena PMP22.

Zašto je genetska dijagnoza neuromuskularne bolesti važna?

Genetski podtip često direktno određuje terapiju — kod spinalne mišićne atrofije postoje uzročne terapije, kod kongenitalnih mijasteničnih sindroma pojedini lijekovi mogu pogoršati simptome, a kod metaboličkih miopatija (npr. Pompeova bolest) dostupna je enzimska nadomjesna terapija. Nalaz je i osnova za genetsko savjetovanje porodice.